居住在六叶镇的双胞胎兄妹，王道游飞和王道游步，是经营着稍微有些可疑的宇宙人驱逐公司UTS（宇宙人纠纷咨询所）的小学生。　　用游飞制作的神秘装置寻找外星人，每天都过着徒劳而辛苦的生活。　　....没错，直到那天！！　　使用最新制作的神秘回收机，二人终于寻找到了真正的宇宙飞船，并在那艘宇宙飞船上邂逅了来自遥远彼方ベルギャー星団的…

2012年2月，东京铁塔上空出现了巨大的数码蛋。就在本宫大辅（20岁）和V仔兽修行拉面技艺的时候，遇到了虽然拿着有裂纹的数码器，但身边没有搭档数码兽的迷之青年——自称“我没有数码兽，我的搭档数码兽被我杀了，我是世界上最初和数码兽建立搭档关系的人类。”